Піразифлумід належить до класу SDHI та порушує процес дихання патогенних грибів у мітохондріях, блокуючи фермент сукцинат-дегідрогеназу. Це призводить до порушення транспорту електронів у II комплексі мембрани мітохондрій, внаслідок чого грибкові клітини втрачають здатність виробляти енергію і гинуть.
Завдяки трифтор-метиловій групі в своїй хімічній структурі, піразифлумід як єдиний представник піризин-карбоксамідів, демонструє значно вищу ефективність проти збудників склеротиніозу, сірої гнилі та оїдіуму у порівнянні з іншими препаратами цього класу.